又是一年大量施肥时， 部分果农为了节省劳力，大量使用未经腐熟(发酵)的畜禽粪便。危害。畜禽粪便中营养成分较高，作为有机肥料越来越受到有机食品与绿色食品生产者的欢迎，其中以猪粪、鸡粪的使用广泛。而新鲜畜禽便直接施入土壤中会招来地下害虫，造成对作物根系的危害。
1、未腐熟(发酵)的畜禽粪便中，植物是无法直接吸收的。有机质在分解过程中产生大量的二氧化碳（CO2）和热量，从而引起烧根现象。另外，未腐熟(发酵)的畜禽便中氮素主要以尿酸态存在，不被作物直接吸收利用，而且对根苗有害。
2、未腐熟(发酵)的畜禽粪便在分解过程中，有大量氮气和其他有害气体放出，容易引起作物中毒，并且造成氮素的大量损失。
3、未腐熟(发酵)的畜禽粪便中，仍含有活性的病原菌、病毒、寄生虫卵、杂草种子等，易给作物传染病虫害，造成土壤水源污染。以生物制剂（堆肥、液肥专用菌种）发酵畜他粪便，在腐熟(发酵)过程中释放热量，堆肥高温能达到50-60℃，可以将一些有害病菌、寄生虫卵、杂草种子等杀死，从而减少病、虫、草对作物的危害。
4、畜禽粪便未腐熟(发酵)时，其碳氮比（C/N）较高，微生物活动需要吸收一部分氮，从而出现微生物和作物争夺氮的现象。
5、施用未腐熟(发酵)的畜禽粪便，对于土壤物理性状影响较大，土壤容重太小，总孔隙度太大，不利于作物发根生长。
6、有机酸毒害：农家肥所产生的有机酸可影响根系，严重的会造成烂烂根，苗生长不良，植株矮小，叶片黄化，似缺肥状；成株期施用过量未腐熟(发酵)的农家肥，可使植株的叶片自上而下变黄，似缺素状；但其地下根不变褐腐烂，有别于作物的根腐病；其维管束不变色，有别于黄萎病与枯萎病。
7、种蝇的危害：种蝇成虫产卵有趋向未腐熟(发酵)粪便的习性，因此，施用未腐熟(发酵)家禽粪便越多，种蝇幼虫为害越重。幼虫危害萌动的钻入根部或茎部，使地上部表现营养不良；危害所造成的伤口，易于病原微生物侵入，引起侵染性病害的发生，造成更大的损失。
